PyMOL(三维分子模型软件)
v2.2.0 官方版大小：366.7 MB 更新：2025/01/08
类别：图像软件系统：WinAll
分类分类
大小：366.7 MB 更新：2025/01/08
类别：图像软件系统：WinAll
PyMOL是一款功能强大且简单专业的三维分子模型制作软件，同时也是一个由用户支持的分子可视化系统，基于开放源代码，由Schrödinger维护和分发，为用户提供全面的分子可视化模型处理环境，使用这款软件用户可以进行专业便捷的三维分子模型处理；PyMOL功能丰富齐全、专业实用，集成的光线跟踪图形技术，可以渲染具有更平滑的表面边界，进而增强3D分子结构的阴影和反射效果，同时该软件支持多种图像格式导入导出，其中包括PDB、SDF以及电子密度图等格式文件，可让用户轻松得到符合要求的图像文件。
借助此分子可视化系统，可以以3D模式对蛋白质，其密度，轨迹和表面进行细微分析
原生视网膜分辨率/ 4k显示支持
停靠/取消停靠并重新排列某些面板(生成器，反馈浏览器，音量编辑器)
用于打开MAE文件，MTZ文件，地图和轨迹文件的专用对话框
新的APBS插件面板
pymolrc脚本编辑器，突出显示语法
属性编辑器
MPEG-4和GIF电影导出面板
Excel导出器插件(Windows和Mac)
通过从文件浏览器拖动到PyMOL窗口来打开文件
组合线/非粘合线和棒/ nb_spheres的导线和甘草制图表达别名
1、支持原子级卡通透明度
2、支持多种图像格式导入导出
3、将对齐文件作为对齐对象加载
4、保存核酸的对齐文件
5、内置强大实用的绘图工具
6、支持触控板手势控制
1、完成软件下载双击软件弹出软件安装弹框，点击next按钮即可进行软件安装
2、完成软件安装后点击finish按钮即可关闭弹框并启动软件
3、弹出软件文件注册界面，该界面可以选择文件类型以向PyMOL注册它们
4、关闭注册弹框即可进入三维分组模型操作界面进行图像处理
5、点击软件左上角的文件按钮弹出软件文件新建、打开、保存、导入导出等功能列表，点击即可进行使用
6、点击打开按钮弹出文件管理弹框，点击选择文件即可进行文件添加
7、点击导出按钮可以将完成编辑处理的图像以多种格式导出软件
8、点击设置按钮可以对软件默认功能和参数进行设置和调整
Bug修复
使用use_shaders = off和line / nonbonded进行拾取
显示预设中的SPC水
读取CMS文件时不要忽略插入代码
环境光遮挡随机斑块
对齐时更新dynamic_measures
修复“重建”内存泄漏
MPEG4导出像素化（anaconda :: ffmpeg与conda-forge :: ffmpeg）
旧版插件：使用模式对话框（macOS和Windows）修复崩溃
PyMOL v2.3.1维护版本（2019年3月28日）
Windows：修复HTTPS的SSL证书位置
处理Python 2 pymolpluginsrc语法错误
MAE导入：区分未定义的（<>）和值为“ <>”的字符串
MAE导出：将未定义的属性写为<>
MAE出口属性：b因子，部分费用，ANISOU
PyMOL v2.3.2维护版本（2019年5月17日）
修复stick_transparency射线跟踪
修复单击下部命令行崩溃的问题
修复等距抽奖
MAE导出：修复空白（空格）链标识符导出
macOS：插件管理器没有XQuartz依赖性
PyMOL v2.3.3维护版本（2019年8月21日）
使用Python 3修复cmd.load_raw（format =“ mmtf”）
MMTF：避免使用可选的groupType字段崩溃（MMTF v1.1dev功能）
修复插件管理器utf-8元数据
插件安装：忽略“测试”
修复macOS 10.15的文件对话框（不要使用本机对话框）
在macOS上修复Zalman立体声
音量面板：手柄pos <0.0
PyMOL v2.3.4维护版本（2019年11月7日）
改善macOS 10.15的兼容性
修复ray_volume回归
PyMOL v2.3.5维护版本（2020年3月6日）
修复macOS 10.15的macOS捆绑包的公证
使用“ pseudoatom”修复崩溃；h_add”
修复损坏的CGO对PSE的加载
修复带有UTF-8标签的PSE加载（Python 3版本）
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